"อาโอ" อดีตนินจาปรากฏตตัวต่อหน้าพวกโบรุโตะในฐานะของศัตรู! ด้วยอุปกรณ์นินจาวิทยาศาสตร์ต่างๆ ที่มีประสิทธิภาพเหนือกว่าทำให้พวกโบรุโตะไม่อาจรับมือไหว ท่ามกลางความเป็นความตาย แผนการที่โบรุโตะคิดขึ้นมาได้ก็คือ!? VS อุปกรณ์นินจาวิทยาศาสตร์เปิดม่านการต่อสู้เต็มรูปแบบ! ยุคสมัยใหม่ของนินจาได้มาถึงแล้ว!!